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1、拌泥沙藏法：取黄连地的泥沙筛去小石块、草根和杂物，干湿度按手捏成团，松开能散为适宜，种子与泥沙的重量比例为1：3，种子与泥沙混合拌匀后储藏在木箱或大口陶瓷缸内，底部垫一层塑料膜，面上盖沙5厘米厚，再盖一层棕叶子。也可靠室内墙脚砌一个宽高均为50厘米，长按需而取的藏种库。高温季节随时开窗通风，藏沙过干时应适当喷水保湿，注意不让鸡犬猫鼠在藏沙上拉屎撒尿导致种子腐烂。
2、净种袋藏法：将种子装在麻袋或布袋内，装量为三分之一袋，封严袋口，然后在室外选一块坡度约15度的地块，挖成深15厘米、宽1米、长按需而定的长方形地坑。坑底放一层2~3厘米厚的河沙，然后将种袋依次放在坑内，压平种袋使袋内种子厚度为3~5厘米，袋面盖细土约5~8厘米厚，藏种坑四周挖排水沟20厘米深，最后用竹木或塑料膜搭遮阳棚保湿避晒，棚高约1米，四周用篱笆拦严。
三、选地整地 育苗地选缓坡生荒地最好，因生荒地土质较肥沃，无病菌污染，少生杂草，熟地易生杂草，不宜作育苗地，9~10月份是最佳整地育苗时间。整地方法：砍去杂草树木烧灰备用，挖去树桩草根，捡净石块及残枝落叶，用钉耙或锄头浅翻表土深10厘米，耙细整平土壤，以1.3米宽，长按需而定，顺坡开箱作畦，挖好排水沟。
四、搭遮荫棚 在箱背中线上每隔2米打一根木桩，桩高1.6米，木桩上端做成“y”字型弯口，放置绑扎竹木枝丫搭遮荫棚，或用黑色塑料遮阳网膜搭棚效果更好。
五、适时播种：10~11月份是最佳播种时间，每亩苗床用净种量2~3公斤，可培育出壮苗25~40万株。播种方法：将种子与细土按1：3混合拌匀，依次播撒在箱畦上，为达到密度均匀，可分2~3次重复播撒，然后挖取箱沟里的细土与适量草木灰混合撒盖箱面，厚度约1厘米，以盖完种子为宜，接着搭好遮荫棚。
六、苗床管理：要培育出高质量壮苗，必须抓好以下管理措施：
1、去除杂物：种子出苗后，随时清除苗床枯枝落叶等残渣物，使苗子顺利生长。
2、去除杂草：部分杂草与连苗共生，互相争肥争光，要及时除掉，一般在3、6、8月份各除草一次，除草时要保护好弱小的连苗，扯草不要损伤连苗，松动了的连苗随手压紧，即时喷洒一次保苗水，以免连叶失水发黄停止生长。
3、施肥催苗：当黄连叶长出3~5柄叶子时开始施追肥，一般在4、7、9月份各施一次。方法是第一次每亩用草木灰混合适量油枯、干鸡粉肥50~80公斤，拌适量细土在晴天撒施。第二次每亩施腐熟去渣的人畜粪水15~20担，每担加入尿素100克泼施。第三次每亩撒施尿素3~5公斤，或阴天无露水时叶面喷施磷酸二氢钾2—3公斤，施后及时用竹丫扫落连苗叶面上的尿素，以防烧伤叶片。
4、适时匀苗：匀苗是培育壮秧的重要措施，有些苗子过密过挤，相互争肥争光，导致幼苗枯黄而死。匀苗方法一是结合扯除杂草时将3—5叶过密的弱秧苗扯匀分栽到较稀的空隙地面，使苗距达1平方厘米1珠为宜。二是出壮留弱，分批出苗，对1—1.5年的秧苗，叶片为6—14柄的壮苗先移栽，弱小苗子留地继续培育，每出苗一批并及时追水肥一次，至到出完为止。
