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1.选地、整地
药用牡丹是根类植物，应选择阳光充足、地势高、排水良好的土地种植，平地、坡地均可。前茬以玉米、棉花等为宜。前茬作物收获后，进行深翻整地，一般翻深50～80厘米，每667平方米（1亩）施基肥3000～5000公斤，加磷、钾肥各50公斤。晾晒土地8～10天后进行细翻，深度为50～60厘米即可，整平做成高畦，畦呈龟背形，以便排水，畦宽1.5～2.0米，沟深30厘米，沟宽40厘米。
2.播种
8月下旬至11月中旬均可进行播种，以9月中旬至下旬为最佳播种时期。播种时应选择籽粒饱满、黑色、具有光泽、无病虫害的种子。播种前，先将种子用45℃的温水浸泡24小时后沥水晾干，待播。目前，一般采用穴播或条播，苗畦宽度以1.2～2米为宜。
穴播：在药材产区，一般按行距30厘米、株距20厘米挖穴，穴位呈品字形排列，穴深10厘米左右，直径在5厘米左右，穴底平坦，每穴施入适量基肥（不能用化肥），然后覆上约3厘米厚的细土，压实整平。一般每穴播种20粒，且在穴内均匀分布。每667平方米用种量150公斤左右。
条播：在药材产区，一般按行距25厘米、播幅宽10～20厘米，横向开6厘米深的播种沟，将种子均匀播入沟内。每667平方米用种量约为100公斤。
穴播或条播后应马上封土，并使畦面平整后加盖茅草。第二年2月下旬至3月上旬即可出苗，出苗前应及时揭除盖草，如遇干旱应及时浇水，两年后可移栽定植。
3.药用牡丹田间管理
移栽定植：一般在秋季落叶后（9～10月），将2年生种苗挖起进行移栽。按行、株距50厘米×30厘米、深20～30厘米挖坑，每坑栽壮苗1株或细苗2～3株。填土时使根系伸直，当土填至一半时，用手将种苗轻轻向上提一下，然后再继续覆土压实，使根部舒展并与土壤密接。栽植后浇足定根水。
中耕除草：移栽第二年春季出芽后开始中耕除草，每年中耕3～4次，保持地内无杂草，土壤疏松。一般结合中耕除草要进行培土。
露根：4～5月间，选择晴天，揭去覆盖物，扒开根际周围的泥土，露出根蔸，让其接受光照。2～3天后结合中耕除草，再培土施肥。
追肥：牡丹喜肥，每年开春化冻、开花以后和入冬前各施肥1次，每667平方米可施腐熟的饼肥150～200公斤。施肥一般结合培土进行。
排灌：如果生长期遇干旱，可在早晨或傍晚浇水。雨季应及时清沟排水，防止积水烂根。
摘蕾与修枝：除留种的植株外，春季现蕾后应及时将花蕾摘除。摘蕾要在晴天露水干后进行，以防伤口感染病害。10～11月剪除枯枝和徒长枝，清除落叶，集中烧毁。
