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无性繁殖
无性繁殖是高等植物中主要的繁殖方法。它利用水草的根、茎、叶等营养器官的再生能力，发芽产生不定根，形成新的水草个体，例如浮萍科的裂片繁殖、莕菜无性的殖芽繁殖、水生蕨类的孢子生殖和不定芽生殖、莲的地下茎、石蒜科水生植物的球茎、泽泻科的花轴不定芽繁殖、眼子菜科的越冬芽以及几乎所有水生植物所共同具有的匍匐茎和走茎繁殖。因此，只要环境适宜，水生植物只要有一段茎或一片叶子就可以繁殖成片的同种水草群体。尤其是它们的营养繁殖非常发达。如牛舌草、苦草、椒草类等水草的根部不断地萌发出新的嫩芽，而这些新芽离开母亲体后又能长出新的植株。再如，金鱼藻、莫丝等水草，当它们的分枝折断之后，每个分枝又可成为新的个体。此外，还有瓜子草，将它的叶子撕下来之后，叶片基部又长出新根，新根就可以长出新的植株。
●根芽法 从母株的根部长出不定芽，在母株的边上长出新枝。
●走茎法 走茎细而圆，匍匐与沙面或横走在沙中，形成侧枝，节上生有鳞片，每隔一节就在节上另外长出不定根及新的个体，如小水兰、水芙蓉。
●茎芽法 自母株底下的根茎、球茎、块茎、鳞茎长出不定芽，由该芽长出新的个体，如青荷根、皇冠草。
●器官法 靠外力将跟、叶、茎、枝条等从茎秆上分离，由这些器官长出新的a 个体，如大叶菊、水芹。
●简单人为法 根据各种水草的特性，人为地将根、茎、叶片切成需要的小段，埋在沙中使他发芽生根，这种方法是目前使用得最广的方法。
●组织培养法 多用于名贵水草的快速繁殖，和简单人为法相似，只是用富含营养的培养基代替了沙土，但比简单人为法的培养速度要快几倍，是名贵和稀有品种水草最好的繁殖方法。因为，名贵水草来之不易。
●有性繁殖 水草的有性繁殖是通过开花、传粉、授精和结实〔形成种子〕白勺过程来完成水草的后代繁衍。水草也有雌雄之分，同一植株上既有雌性花又有雄性花，称为雌雄同株；雄性花与雌性花不在同一植株上的称为雌雄异株，它们的花为单性花。
有性繁殖的花粉传授方式主要的途径有昆虫传粉和水流传粉，有些水草将花开在水面上，昆虫在采集花粉时无意间为水草传递花粉；水流传粉是水草将花开在水面或水中，由水的流动使花受粉。另外，还有一些水草在水位高时，可以用闭锁的方法传授花粉。它们将花开在花苞中，直接在花苞中结果，这在双子叶水草中最为普遍。除了传花授粉外，在水草的群体中，有些水草是两性花，有些水草是单性花。大多数水草都由异花受粉，所以它们需要有传粉的媒介。由于水草的种类不同，受粉的方式也有很大的区别，如苦草、赤藻、金鱼藻等水草是以水为传粉媒介，故叫水媒花。再如苦草属雌雄异株，它的雌花成熟时，花序柄很快地伸长，将花挺出水面，让花在水面上开放，而雄花成熟后冲破雄性佛焰苞，脱离花序，浮到水面，随着水的游动，使它有机会靠近雌花，促使花粉有可能雌花的柱头上，使之受粉。受粉后的雌花，因花序的柄呈螺旋状蜷曲，慢慢地将果拉入水中成熟。
黑藻也是雌雄异株的水草，与苦草不同的是雌花只是在临近水面开放，雄花成熟后也冲破佛焰苞脱出，同时将花粉撒入水中，凭借花粉含有淀粉的重量，使花粉容易地下沉而落在柱头上来进行受粉，受粉后发育成果实。
还有一种狐尾藻，它的花极度退化，花伸出水面，成熟后的花粉散布于空气中，随着风和气流在空气中飘动，柱头上的面积渐渐扩张，后发展成羽毛状，使得水面上的花粉有更多的机会碰上柱头，而达到受粉的目的，所以叫风媒花。受粉后的子房发育成果实，而胚腺发育成种子，种子再萌发为新的植株，这就是有性繁殖的全过程。
依靠有性生殖细胞繁衍后代，也是一种生殖方法，但这种繁殖方法在水草中已经很少。
●种子萌发 成熟的种子在没有外界干扰的条件下是处于静止状态的，这时种子含水分只有10％。种子在适宜的温度下吸收水分，这时种子所含水分达95％。到种子获得水分后，种子的表皮开始软化，种子中酵素开始活动，对种子中的养分进行分解，变为可溶性营养供胚芽吸收，使胚芽细胞分裂、分化而生长。胚芽的生长变大所产生的压力，使种子的外壳破裂，胚芽与子叶被推出而成为幼苗。
培育水草新品种的常规方法是杂交和嫁接，而在水草中大多是不具备有性繁殖的能力，因此，他们的种子也就很难收集，这就决定了开发水草的新品种用杂交的方式较为困难，嫁接方法更是不可能，但是，可以利用培养基因的方法，运用多种手段来打破水草的遗传因素，改变它原有的特性而产生新的品种。
