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砧木育种相较于接穗育种的难度较高，主要体现在以下几个方面。
1. 物种适应性差异
不同砧木的生长习性和环境适应性不同，所以在选择合适的砧木进行育种时需要考虑其对栽培条件的适应性。而接穗育种则不需要考虑这个问题，因为接穗是在相同的砧木上进行嫁接。
2. 遗传背景复杂
砧木是整株植物，具有一套完整的基因组，其遗传背景比较复杂。这使得在进行砧木育种时需要考虑更多的遗传因素，比如遗传多样性和基因交互作用。而接穗育种只需要考虑接穗的遗传特性，遗传背景相对较为简单。
3. 病虫害抵抗性差
由于砧木的基因组复杂性，其抗病虫害能力相对较弱。在繁殖砧木时，需要考虑种植砧木的病虫害防治措施，以保证苗木的健康生长。而接穗育种则无需考虑砧木的抗病虫害能力，因为接穗通常是选择抗病虫害的接种材料进行嫁接。
4. 生长周期长
砧木的生长周期较长，从育种工作到最终获得优良品种需要较长时间的培育和筛选。而接穗育种在嫁接后往往能更快地获得相应的结果，缩短了育种的周期。
综上所述，砧木育种相较于接穗育种难度更大，需要考虑更多的因素和复杂的遗传背景。然而，砧木育种也是培育优良品种、提高作物抗性以及适应各种环境的重要手段之一。
感谢您阅读本文，希望通过本文的解答，能对您对砧木育种与接穗育种的难易程度有更全面的了解，同时也为您在相关领域的研究和实践提供一些帮助。
